Προϊόντα

Οι μετα-μεταφραστικές τροποποιήσεις πρωτεΐνης, όπως η φωσφορυλίωση τυροσίνης, ρυθμίζουν τις αλληλεπιδράσεις πρωτεΐνης-πρωτεΐνης (PPIs) που είναι κρίσιμες για την επεξεργασία σήματος και τους κυτταρικούς φαινοτύπους.Επεκτείναμε ένα καθιερωμένο σύστημα δύο υβριδίων ζυμομύκητα που χρησιμοποιεί ανθρώπινες πρωτεϊνικές κινάσες για τις αναλύσεις PPI που εξαρτώνται από φωσφο-τυροσίνη (pY) σε μια άμεση πειραματική, μεγάλης κλίμακας προσέγγιση.Εντοπίσαμε 292 ως επί το πλείστον νέους PPI εξαρτώμενους από το pY που έδειξαν υψηλή ειδικότητα σε σχέση με τις κινάσες και τις αλληλεπιδρώντες πρωτεΐνες και επικυρώσαμε ένα μεγάλο κλάσμα σε πειράματα συν-ανοσοκαθίζησης από κύτταρα θηλαστικών.Περίπου το ένα έκτο των αλληλεπιδράσεων διαμεσολαβούνται από γνωστά μοτίβα σύνδεσης γραμμικής αλληλουχίας ενώ η πλειονότητα των pY-PPIs διαμεσολαβείται από άλλους γραμμικούς επιτόπους ή διέπεται από εναλλακτικούς τρόπους αναγνώρισης.Η ανάλυση δικτύου αποκάλυψε ότι τα συμβάντα αναγνώρισης με τη μεσολάβηση pY συνδέονται με μια άκρως συνδεδεμένη μονάδα πρωτεΐνης αφιερωμένη σε μονοπάτια σηματοδότησης και ανάπτυξης κυττάρων που σχετίζονται με τον καρκίνο.Χρησιμοποιώντας προσδιορισμούς δέσμευσης, πρωτεϊνικό συμπλήρωμα και φαινοτυπικές ενδείξεις για τον χαρακτηρισμό των εξαρτώμενων από το pY αλληλεπιδράσεις του TSPAN2 (τετρασπανίνη 2) και του GRB2 ή του PIK3R3 (ρ55γ), παρέχουμε υποδειγματικά στοιχεία ότι οι δύο PPI που εξαρτώνται από το pY υπαγορεύουν φαινοτύπους κυτταρικού καρκίνου.