Προϊόντα

Έχει χρησιμοποιηθεί φασματοσκοπία υπέρυθρης ακτινοβολίας για τη χαρτογράφηση αλληλεπιδράσεων υποστρώματος-πρωτεΐνης: οι αλλαγές διαμόρφωσης του σαρκοπλασμικού δικτύου Ca(2+)-ATPase κατά τη δέσμευση νουκλεοτιδίων και τη φωσφορυλίωση της ΑΤΡάσης παρακολουθήθηκαν χρησιμοποιώντας το υπόστρωμα ATP και ανάλογα ATP (2'-δεοξυ-ATP, 3 '-δεοξυ-ΑΤΡ, και 5'-τριφωσφορική ινοσίνη), τα οποία τροποποιήθηκαν σε συγκεκριμένες λειτουργικές ομάδες του υποστρώματος.Τροποποιήσεις στο 2'-ΟΗ, το 3'-ΟΗ και την αμινομάδα της αδενίνης μειώνουν την έκταση της επαγόμενης από τη δέσμευση διαμορφωτικής αλλαγής της ΑΤΡάσης, με ιδιαίτερα ισχυρά αποτελέσματα που παρατηρούνται για τις δύο τελευταίες.Αυτό καταδεικνύει τη δομική ευαισθησία του συμπλόκου νουκλεοτιδίου-ΑΤΡάσης σε μεμονωμένες αλληλεπιδράσεις μεταξύ νουκλεοτιδίου και ΑΤΡάσης.Όλες οι ομάδες που μελετήθηκαν είναι σημαντικές για τη σύνδεση και οι αλληλεπιδράσεις μιας δεδομένης ομάδας συνδέτη με την ΑΤΡάση εξαρτώνται από τις αλληλεπιδράσεις άλλων ομάδων συνδέτη.Παρατηρήθηκε φωσφορυλίωση της ΑΤΡάσης για ΙΤΡ και 2'-δεοξυ-ΑΤΡ, αλλά όχι για 3'-δεοξυ-ΑΤΡ.Δεν υπάρχει άμεση σχέση μεταξύ της έκτασης της διαμορφωτικής αλλαγής κατά τη δέσμευση νουκλεοτιδίων και του ρυθμού φωσφορυλίωσης που δείχνει ότι η πλήρης έκταση της επαγόμενης από ΑΤΡ διαμορφωτικής αλλαγής δεν είναι υποχρεωτική για φωσφορυλίωση.Όπως παρατηρήθηκε για το σύμπλεγμα νουκλεοτιδίου-ΑΤΡάσης, η διαμόρφωση του πρώτου ενδιάμεσου φωσφορυλιωμένης ΑΤΡάσης E1PCa(2) εξαρτάται επίσης από το νουκλεοτίδιο, υποδεικνύοντας ότι οι καταστάσεις ΑΤΡάσης έχουν λιγότερο ομοιόμορφη διαμόρφωση από ό,τι αναμενόταν προηγουμένως.